lot size = lot quantityと言い換えられるかと思います。
http://www.businessdictionary.com/definition/lot-size.html

http://m-words.jp/w/E383ADE38383E38388.html
↑によると、ロットとは「製品を生産する際に分けられた最小単位（ダースなど）」ですから、ここではつまり、

コンポーネント（自動車部品の更に下のレベルの部品類）の梱包については、工場Ａについては車１台を生産するのに必要なロット数、工場Ｂについては車30台を生産するのに必要なロット数をそれぞれの単位とすること。（つまり工場Ｂについては、生産台数30台分のコンポーネントが最小納入単位ですよ、ということ。）

という意味ではないでしょうか？

各工場の生産ラインの規模、生産ラインの多様性（車種）やライン速度の違いから、工場Ａと工場Ｂに対して、それぞれ異なる指示が出るのだと思います（自動車メーカーがサプライヤーに出す指示かと思われます）。